《表2 HbCSN1～HbCSN8蛋白的特征分析Tab.2 Characterization of identified HbCSN1—HbCSN8 proteins.》

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《橡胶树COP9家族基因的克隆及表达分析》

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通过比对分析，在橡胶树热研8-79中发现了8个匹配COP9家族基因的unigene，经过ORF（open reading frame）分析，发现这8个unigene不具有完整的阅读框，因此进行了5′-RACE，3′-RACE分析，通过拼接及RT-PCR扩增测序验证，获得了8个具有完整阅读框的COP家族基因，根据与拟南芥的同源性，我们将这8个成员分别命名为HbCSN1～HbCSN8，并将HbCSN1～HbCSN8的全长cDNA序列登陆NCBI，GenBank登录号分别为KX156270～KX156277。以热研73397的基因组中CSN基因序列为依据，采用GSDS2.0分析了HbCSN1～HbCSN8的基因结构，结果表明橡胶树中的CSN基因家族成员的基因结构均是由多个外显子及多个内含子组成（图1）。COP家族基因HbCSN1～HbCSN8的ORF长594～1320 bp，编码197～439个氨基酸，蛋白质的分子量（molecular weight，MW）介于22.641～51.395 ku之间，理论等电点pI介于4.98～6.26之间。根据NCBI的CDD保守结构域预测显示，HbCSN1、HbCSN2、HbCSN3、HbCSN4、HbCSN7和HbCSN8具有PCI结构域，HbCSN5和HbCSN6具有MPN结构域（表2）。HbCSNs蛋白序列的亚细胞定位预测结果显示，HbCSN1、HbCSN2、HbCSN3被定位于细胞质内；HbCSN4和HbCSN6被定位于叶绿体中；HbCSN5和HbCSN7被定位于细胞核中；HbCSN8被定位于微体（过氧物酶体）中。