《表4 茶树CsLHTs亚家族蛋白理化性质分析》
利用Editseq软件对序列进行ORF查询并推导编码的氨基酸序列,然后通过ProtParam在线计算推导蛋白质基本理化性质。结果(表4)显示,茶树CsLHTs亚家族基因编码氨基酸数在438~523之间;相对分子量最小的为CsLHT6,为48.90 kD,最大的为CsLHT8.2,为57.68 kD;理论等电点均在8.5以上,为碱性蛋白;不稳定系数在40以下为稳定蛋白,该亚家族的不稳定系数在32.60~41.41,除CsLHT6为不稳定蛋白外,其余均为稳定蛋白;亲水性平均系数在0.432~0.504,为正值,表明该亚家族均为疏水蛋白,与Protscale中预测的结果一致;利用SignalP 4.1进行蛋白信号肽预测,结果发现该亚家族基因的蛋白质均不含信号肽,属于非分泌型蛋白;ProtCompVersion 9.0亚细胞定位结果表明,5个蛋白位于质膜上;TMHMM进行蛋白跨膜结构分析结果显示该亚家族基因含有9~11个跨膜结构域。通过NCBI的CDD在线数据库分析,每个序列都归属于SLC5-6-like_sbd亚家族,此外,CsLHT1和CsLHT2含有Aa_trans(Transmembrane amino acid transporter protein登录号:PF01490)结构域。
图表编号 | XD0054615300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.15 |
作者 | 郭玲玲、张芬、张亚真、成浩、韦康、阮丽、吴立赟、王丽鸳 |
绘制单位 | 中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心、中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心 |
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