《表5 茶树CsLHTs亚家族蛋白二级结构预测》

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《茶树CsLHTs亚家族基因的克隆与表达分析》


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通过对蛋白质结构的分析可以得到更多的关于其功能机制的信息,因此我们利用在线工具Sopma对5个茶树CsLHTs编码的氨基酸序列进行二级结构预测。结果(表5)显示,该亚家族基因编码氨基酸序列均包含α螺旋、β转角、无规则卷曲和延伸链。CsLHT1、CsLHT2和CsLHT6中α螺旋为主要的二级结构组成部分,CsLHT8.1和CsLHT8.2中占比最多的是无规则卷曲。Swiss-Model同源建模预测结果(图1)显示,5个CsLHTs均与钠偶联中性氨基酸转运体9(Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9)同源,且从空间构象上看,与二级结构的预测结果一致。