《表4 BRI1蛋白家族成员的二级结构预测》

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《菠萝蜜BRI1家族成员生物信息学的预测与对比》


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蛋白质二级结构是一种有规则的重复构象,骨架上的羰基和酰胺基团之间的氢键是主要维持力(沈辰等,2014)。利用SOPMA分析菠萝蜜RI1蛋白家族的二级结构(表4)。结果显示,无规则卷曲和琢-螺旋是主要二级结构元件(无规则卷曲占比48.20%~49.57%,琢-螺旋占比33.76%~35.53%),其次是延伸链和茁-折叠(延伸链占比13.50%~13.81%,茁-折叠占比2.44%~3.35%)。分析其余蛋白家族成员,发现有相似的结果。