《表2 DlHDAC家族成员蛋白质二级结构组成》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《龙眼HDAC家族成员的全基因组鉴定及表达分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

%

蛋白质二级结构指蛋白质的多肽链中有规则重复的构象，限于主链原子的局部空间排列，不包括与肽链其他区段的相互关系及侧链构象，蛋白质二级结构影响蛋白质的稳定性。对DlHDAC家族蛋白的二级结构进行预测，结果（表2）显示，RPD3/HDA1亚家族的9个成员，α-螺旋所占比例都在30%以上，无规则卷曲所占比例都在35%～45%，伸展链和β-转角所占比例相对较低。SIR2亚家族所含二级元件数量与RPD3/HDA1亚家族类似，二级元件占的比例由高到低依次为无规则卷曲、α-螺旋、伸展链和β-转角。HD2亚家族的二级结构明显不同于RPD3/HDA1亚家族和SIR2亚家族，HD2亚家族中的DlHDT1和DlHDT3含α-螺旋数少于其他成员，而无规则卷曲所占比例相对较高，其中DlHDT3含无规则卷曲在整个家族占比例最高，为72.58%，含α-螺旋所占比例最低，为7.36%。HD2亚家族具有独特的蛋白二级结构，预测是由于HD2亚家族是植物特有的一类组蛋白去乙酰化酶所致。