《表1 DlHDAC家族基本理化性质分析》

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《龙眼HDAC家族成员的全基因组鉴定及表达分析》


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在龙眼中共筛选出14个具有完整保守结构域的HDAC家族成员。参考拟南芥HDAC的命名方法进行命名,预测分析DlHDAC家族蛋白基本理化性质及亚细胞定位。结果(表1)表明,DlHDAC所有成员均为于亲水性蛋白质,各亚家族成员序列长度差异较大,氨基酸个数为282~1 044 aa。其中RPD3/HDA1亚家族的9个成员,氨基酸个数在351~1 044 aa,蛋白的等电点在5.09~5.65,均呈酸性,蛋白分子质量在37.92~114.82 kD。HD2亚家族的2个成员的理化性质基本一致,氨基酸数目在290 aa左右,等电点均在5.0左右,呈酸性,都属于不稳定亲水性蛋白。SIR2亚家族成员的理化性质与其他2个亚家族略有不同,等电点在7.0~9.0,为碱性蛋白质。亚细胞定位预测结果显示有9个成员定位于细胞核上,2个定位于细胞质,2个定位于内质网,1个定位在线粒体。