《表2 藜麦DAPB家族成员理化性质分析》

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《藜麦DAPB基因丰度及生物信息学分析》


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为了解藜麦中DAPB的可能生物学功能,本研究通过HMMER搜索,从藜麦中筛选鉴定得到4个DAPB基因,分别是NW_018742907.1、NW_018742-966.1、NW_018744955.1和NW_018744460.1。对整个DAPB家族成员进行比较表明:DAPB基因的氨基酸序列长度为约为330 bp;平均相对分子质量为36.623~36.880 k D;理论等电点(p I)为5.79~6.01,呈酸性;不稳定性指数为46.19~47.56;脂肪族指数为81.60~87.01;最大疏水系数为0.028~0.123,为疏水性蛋白;亚细胞定位预测表明DAPB均定位在细胞质中;对DAPB家族蛋白序列进行跨膜区分析发现,DAPB不存在跨膜区(表2)。