《表2 二级结构预测：马铃薯APX基因家族的生物信息学分析》

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《马铃薯APX基因家族的生物信息学分析》

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通过拟南芥、番茄和水稻中已鉴定的APXs基因蛋白序列利用本地BLASTP检索马铃薯蛋白数据库以及利用植物APX蛋白保守结构域建立的HMM模型（PF00141）检索获得的序列作为马铃薯APXs候选序列。通过生物信息学方法进一步验证，最终从马铃薯蛋白数据库中检索出了8个St APXs基因。根据各成员在染色体上的位置进行命名（St APX1～8），并对理化性质进行了分析，发现该基因家族成员编码的氨基酸数目在250～420之间，分子量27.35～45.83 k D不等，等电点介于5.62～7.65之间，GRAVY值均小于0。亚细胞定位预测的结果显示，有5个St APXs基因编码的蛋白位于过氧化物酶体中，2个定位于细胞质，值得注意的是St APX8在叶绿体和线粒体均有分布（表1）。二级结构预测发现，St APXs蛋白均主要由α螺旋和无规卷曲组成（表2）。