《表3 Ka/Ks分析：马铃薯APX基因家族的生物信息学分析》

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《马铃薯APX基因家族的生物信息学分析》

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Ka/Ks是异义替换（Ka）与同义替换（Ks）的比值。其可以判断是否有选择压力作用于蛋白编码基因，在进化分析中有着重要意义（Hurst，2002）。本研究通过对马铃薯8个St APXs基因编码区之间Ka/Ks分析，发现该家族成员之间的Ka/Ks值均大于1，说明St APXs基因成员具有正向选择效应（表3）。通过将拟南芥、番茄、水稻以及马铃薯中的APX蛋白序列共计31条进行比对后构建NJ树，发现马铃薯St APXs基因与番茄Sl APXs亲缘关系最近，其次是拟南芥，与水稻Os APXs成员的同源性较低（图1）。