《表4 蛋白质的二级结构:油棕植物激素相关基因的生物信息学分析》

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《油棕植物激素相关基因的生物信息学分析》


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利用SOPMA在线对氨基酸的二级结构进行预测(表4)。结果表明,EgGA20ox 1-D蛋白的二级结构中α螺旋占比37.31%,延伸链占比17.62%,β转角占比5.18%,无规则卷曲占比39.90%;GA20ox 2蛋白的二级结构当中α螺旋占比32.54%,延伸链占比16.67%,β转角占比5.29%,无规则卷曲占比45.50%;EgYUC1蛋白的二级结构当中α螺旋占比42.56%,延伸链占比15.22%,β转角占比6.57%,无规则卷曲占比35.64%;EgACS蛋白的二级结构当中α螺旋占比30.25%,延伸链占比21.38%,β转角占比9.00%,无规则卷曲占比39.37%。其中EgGA20ox 1-D,EgG-A20ox 2及EgACS蛋白主要以无规则卷曲为主,其次是α螺旋,β-转角所占比例最小。但对于EgY-UC1而言,α螺旋所占比例最大。