《表1 PEPC和PPDK蛋白理化性质及亚细胞定位》
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《转玉米PEPC和PPDK基因杨树苗期的光合生理特性》
利用生物信息学工具对玉米PEPC和PPDK基因编码蛋白进行分析和预测,蛋白理化性质及亚细胞定位如表1所示,PEPC蛋白定位于细胞质中,PPDK蛋白定位于叶绿体中,与其家族蛋白亚细胞定位一致,2个蛋白与各自家族蛋白成员相同均不含有信号肽和跨膜结构,并各自具有本家族蛋白保守的结构基序和活性位点。PEPC基因编码蛋白序列中,具有形成与PEPC蛋白家族功能密切相关的典型裂缝结构的4个保守基序(FHK-x-W,SWYKWP,TAHPT-x-R,M-x-GYSDS-x-K-x-G,其中x为非保守位点),并具有保守的活性催化位点K和H;PPDK基因编码蛋白序列中,具有与PPDK蛋白家族催化作用密切相关的3个保守基序(K-x-P-xDL-x-N-x-YK,G-x-NDL-x-Q-x-R,G-G-x-H-x-R)及保守的活性催化位点K和H。通过对蛋白结构进行的生理生化、结构域基序、信号肽、功能位点等相关分析和预测,表明玉米PEPC和PPDK基因编码蛋白均具有其相关家族高度保守的功能域,2个基因均为光合作用关键酶的编码基因。
图表编号 | XD00152044100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.01 |
作者 | 孙伟博、宫新栋、周燕、李红岩 |
绘制单位 | 南京林业大学生物与环境学院、南京林业大学生物与环境学院、南京林业大学生物与环境学院、南京林业大学生物与环境学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |