《表1 谷子PYL蛋白的理化性质分析及亚细胞定位预测》

《表1 谷子PYL蛋白的理化性质分析及亚细胞定位预测》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《谷子PYR/PYL/RCAR基因家族进化及表达分析》


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注:TargetP,Pprowler,Wolfpsort,SignalP:四种预测工具;Yes:该蛋白具有信号肽;No:未检测到信号肽;MTP:线粒体靶向肽

利用ExPASy网站(https://www.expasy.org/)对谷子中PYL蛋白的一级结构及理化性质进行了预测,并使用4种预测工具对PYL家族进行亚细胞定位分析(表1),谷子PYL蛋白质序列的长度范围为175个到220个氨基酸;分子量在18.81~23.67 kD之间;除基因Si3G207900.1外,其它PYL蛋白的等电点均小于7;除了Si9G437300.1基因外,其它8个PYL蛋白均为亲水性蛋白。关于其亚细胞定位,由于不同软件的计算方法不同,预测结果也稍有差异,但是大部分结果是一致的,谷子中大部分PYL基因定位于细胞内,基因Si5G369100.1、Si9G437300.1和Si3G076200.1可能定位于线粒体。利用线上工具SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)对谷子PYL蛋白的二级结构进行了预测(表2),结果显示PYL蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,β-转角所占百分比最小。