《表4 嗜根考克氏菌的应答调控蛋白的亚家族分类》

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《嗜根考克氏菌双组分信号转导系统的生物信息学分析》

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RRs是执行特定细胞反应以响应由HKs检测到的信号的关键因子，一般由两部分组成（图1）。RRs在N端含有一个或多个保守的接受结构域（receiver domain，REC），又称为输入结构域（Input domain），该结构域的天冬氨酸接收来自HKs的组氨酸上携带的磷酰基，从而使TCS的两种蛋白通过磷酸化反应进行交流。此外，大多数RRs的C端含有一个或多个效应结构域（Effector domain），最常用作DNA结合转录因子（Galperin，2006）；其他类型的RRs包含RNA结合、配体结合、蛋白结合或转运输出结构域，并在转录、转录后或翻译后水平发挥调节作用（Galperin，2010）。根据嗜根考克氏菌RRs输出区域的差异，可将其分为Omp R、Cit B、Nar L、Chemotaxis等亚家族。嗜根考克氏菌的大部分RRs属于Omp R和Nar L亚家族，其中1个属于Cit B亚家族，另一个属于Chemotaxis亚家族（表4）。Omp R和Nar L分别代表所有与DNA结合的RR的最大和第二大亚家族，并分别包含翼螺旋-转角-螺旋和螺旋-转角-螺旋（HTH）效应结构域。