《表1 茶树PEBP基因家族的序列特征》

《表1 茶树PEBP基因家族的序列特征》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《茶树PEBP基因家族结构与功能特征分析》


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利用拟南芥PEBP蛋白质序列作为Query序列,进行本地Blast,搜索茶树基因组中的PEBP基因家族成员,阈值设为E<10-5,最终鉴定获得7个PEBP基因家族成员,编号分别命名为Cs CEN-BE、Cs CEN-AE、Cs MFT、Cs CEN-BE2、Cs MFT2、Cs MFT-E、Cs HD。茶树PEBP基因家族成员的编码序列长度及氨基酸数目差别不大,分布范围分别为399~549 bp,133~183 aa。利用在线分析工具Ex PASy对茶树PEBP基因的蛋白质序列进行分析,发现该蛋白家族的分子量14.39~20.19 k D,等电点为6.26~9.01,大部分蛋白质等电点大于7,为碱性蛋白(表1)。茶树PEBP基因家族蛋白性质分析结构表明,该基因家族分子量相对较小,在提取纯化过程中可能存在一定的困难;值得注意的是大多数PEBP基因编码弱碱性蛋白,可能在偏碱性的亚细胞环境中发挥作用。