《表1 茶树PEBP基因家族的序列特征》
利用拟南芥PEBP蛋白质序列作为Query序列,进行本地Blast,搜索茶树基因组中的PEBP基因家族成员,阈值设为E<10-5,最终鉴定获得7个PEBP基因家族成员,编号分别命名为Cs CEN-BE、Cs CEN-AE、Cs MFT、Cs CEN-BE2、Cs MFT2、Cs MFT-E、Cs HD。茶树PEBP基因家族成员的编码序列长度及氨基酸数目差别不大,分布范围分别为399~549 bp,133~183 aa。利用在线分析工具Ex PASy对茶树PEBP基因的蛋白质序列进行分析,发现该蛋白家族的分子量14.39~20.19 k D,等电点为6.26~9.01,大部分蛋白质等电点大于7,为碱性蛋白(表1)。茶树PEBP基因家族蛋白性质分析结构表明,该基因家族分子量相对较小,在提取纯化过程中可能存在一定的困难;值得注意的是大多数PEBP基因编码弱碱性蛋白,可能在偏碱性的亚细胞环境中发挥作用。
图表编号 | XD00220569300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.28 |
作者 | 刘合霞、刘秦、周兴文、朱宇林、李博 |
绘制单位 | 玉林师范学院生物与制药学院、玉林师范学院生物与制药学院、玉林师范学院生物与制药学院、玉林师范学院生物与制药学院、玉林师范学院生物与制药学院 |
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