《表1 杨树FBA基因家族的序列特性》

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《杨树FBA基因家族的鉴定及生物信息学分析》

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本研究以已确定的拟南芥FBA蛋白序列作为查询序列，对毛果杨基因组进行BlastP搜索与筛选，手动去除冗余并经InterProScan和SMART数据库验证后，共鉴定出9条FBA基因序列。利用生物信息方法，对杨树FBA家族基因的分子量、等电点、序列长度、亚细胞定位等基本属性进行了分析，并根据基因在染色体上的位置和亚细胞定位的结果，将9条基因进行重新命名（表1）。分析结果表明，9条PtFBAs基因序列的长度差异较大，其中PtFBA5基因序列长度最长有3482bp，而PtFBA3的基因长度只有1 842 bp；CDs序列长度与蛋白序列的长度差异较小，平均长度分别为1 136 bp和378 aa；PtFBAs基因的分子质量范围为38.38～42.88kD，平均分子质量为40.82kD；理论等电点的范围为6.62～8.78，平均等电点为7.79。亚细胞定位预测结果显示，9条PtFBAs基因中有4条（PtFBA1，PtFBA3，PtFBA8和PtFBA9）被定为在细胞质中，另外5条（PtFBA2，PtFBA4，PtFBA5，PtFBA6和PtFBA7）则被定位于叶绿体上。