《表1 引物序列:杨树PeNHLd基因的克隆与表达模式分析》

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《杨树PeNHLd基因的克隆与表达模式分析》


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在前期研究中,杨树基因组芯片分析表明NHLd基因在南林895杨硬枝插穗水培生根过程中差异表达。以其探针序列设计引物(表1),PCR扩增获得845 bp目的基因片段,据此基因片段进行3'RACE和5'RACE巢式PCR扩增,经序列拼接、ORF预测及其测序验证,获得总长为1 971 bp的cDNA全长序列(图1A)。杨树PeNHLd基因cDNA全长为1 971 bp,包括1个1 449 bp的开放阅读框、174 bp的5'-端非翻译区、348 bp的3'-端非翻译区。以DNA为模板,PCR扩增得到PeNHLd基因的基因组序列。通过将cDNA序列与基因组序列比对揭示该基因含6个内含子和7个外显子(图1B)。