《表2 相关mi RNA靶基因的功能分析》

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《杨树10种miRNA的低氮胁迫差异表达及靶基因的鉴定与分析》

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本研究利用psRNATarget软件，进一步预测了上述10个miRNA的靶基因，共获得294个靶基因。其后将得到的靶基因与phytozome杨树基因组数据库比对，并进行功能注释和归类（表2）。同属于一个家族的pto-miR156a、pto-miR156k和pto-miR156g具有不同的靶基因个数分别为50个、54个、73个，但是靶基因功能有相似性（SBP domain）；pto-miR160g和pto-miR160e也具有相同数目的靶基因个数（18）和相似的靶基因功能（Auxin response factor）。此外，miR399i共预测到6个靶基因，其功能注释主要为ubiquitin-conjugating enzyme family protein；miR167a预测到3个靶基因，其功能主要注释为CBF-B/NF-YA family protein；miR159a预测到40个靶基因，其主要功能注释为MYB Transcription Factor；miR169u预测到12个靶基因，其主要功能注释为CBF-B/NF-YA family protein。miR6427预测到20个靶基因，其主要功能为Anthocyanidin。