《表3 部分已知及新mi RNA潜在靶基因》

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《南方型紫花苜蓿(Medicago sativa 'Millenium')耐盐相关miRNAs及靶基因预测》

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根据发现的miRNA与对应物种的基因序列信息，使用psRNATarget、TargetFinder和Tapirhybrid软件进行靶基因预测，并取其交集，提高数据的准确性。结果表明ps RNATaget、TargetFinder和Tapurhybrid共预测到已知miRNA靶基因总数分别为3 218、2 857、2 977，预测到的新miRNA靶基因总数分别为1 247、956与1 024。这3种不同的预测方式共预测了1 190个相同的潜在靶基因（图3），其中986个属于已知miRNA（图3A），204个属于新miRNA（图3B）。部分已知miRNA及新miRNA的潜在靶基因（表3），大多数miRNA以一系列转录因子及抗病蛋白为靶点，如miR169的靶基因为NF-YA转录因子、miR172的靶基因为AP2类转录因子、miR156的靶基因为SPL转录因子，这些miRNA所调控的靶基因对植物的生长发育均起着重要的作用。