《表2 所有盐碱反应性mi RNA靶基因的KEGG通路富集的类别》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《microRNA调控膜系统及离子转运介导青稞盐碱胁迫的应答》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注：ko代表KEGG代谢及信号通路的通路，04626等是在KEGG中的通路的编号。

mi RNA的功能通常是靶基因的转录后调控，由于与特定m RNA的序列互补性，导致蛋白质翻译抑制或裂解[25]，总共363个差异表达的mi RNA具有潜在的靶标候选物，映射到了Swiss Prot数据库的靶标基因。mi RNA预测的靶标数量差异很大，范围为1～2 107，总共为363个mi RNA确定了7 608个唯一的目标候选物。大多数mi RNA(224个）具有多个靶基因（2～100个），83个mi RNA仅具有1个靶基因，56个mi RNA每个具有100多个靶基因。mi RNA及其靶基因的一些例子显示了相反的表达模式。该靶标预测分析表明，已鉴定的靶标基因调控了广泛的生物学过程。所有这些目标基因均按照基因本体（GO）数据库进行功能分类（表1）。在细胞成分（cellular component）类别中，前10个GO类别显示大多数目标基因与膜相关（GO:0016020，GO:0016021，GO:0031224，GO:0044425和GO:0012505等）。在生物过程（biological process）类别中，最富集的条目与运输相关（GO:0044765，GO:0006811，GO:0006810，GO:0006812，GO:0055085和GO:0030001）。在分子功能（molecular function）类别中，转运蛋白活性（GO:0005215）、离子结合（GO:0005507和GO:0030001）、过氧化物酶活性（GO:0004601）、氧化还原酶活性（GO:0016684）和抗氧化活性（GO:0016209）是显著富集。分析发现，与“膜”相关的miRNA-m RNA调控网络中，Thb-mi Rn724a-3p、Thb-mi Rn724-1-5p和Thb-mi Rn1158-3p位于网络的中心。KEGG通路富集分析表明，最富集的6个通路展示在表2中，其中“植物-病原体相互作用”和“植物激素信号转导”分别富集到248和149个靶向基因。此外，靶基因GO富集分析显示，目标基因在2 h阶段显著富集了氧化还原酶活性（GO:0016682，GO:0016491和GO:0016679）和阳离子结合（GO:0043169）。24 h时富集的GO条目是ATP酶活性（GO:0042623，GO:0042626和GO:0043492）和水解酶活性（GO:0016820）。在48 h的靶基因GO分析显示出金属簇结合（GO:0051540）、核苷酸结合（GO:0000166）和核苷三磷酸酶活性（GO:0017111）富集，而在72 h条件下的靶基因富集氧化还原酶活性（GO:0016682，GO:0016679和GO:0016491）和铜离子结合（GO:0005507）。