《表1 Hr CAT家族基因的核酸序列分析》

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《沙棘CAT家族基因的生物信息学分析》


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对沙棘转录组测序得到的数据进行注释与筛选,获得了CAT家族基因中的3个成员,分别命名为HrCAT1、HrCAT 2和HrCAT3。通过NCBI网站上的ORF finder工具,分析3种HrCAT基因的核酸序列。结果表明,3种HrCAT基因分别具有长度为3646,1 373,2 387 bp的完整开放阅读框(open reading frame,ORF),分别编码540,353,648个氨基酸,表明3种HrCAT基因均具有编码完整基因的独立性(表1)。疏水性总体平均值分别为0.547,0.429和0.557,属于疏水性蛋白。