《表2 甜橙MAPK基因家族的序列分析》
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《柑橘MAPK基因的生物信息及其响应溃疡病菌侵染的表达分析》
通过拟南芥的MAPK基因家族的氨基酸序列从华中农业大学甜橙基因组数据库中筛选出12个候选的MAPK同源基因(表2),根据与拟南芥的MAPK基因的同源性进行命名(UPGMA Tree)。柑橘MAPK家族各成员的氨基酸残基数量差别较大,为368~619 aa不等,外显子数为3~10个;利用Prot Param在线软件进行分析,显示柑橘MAPK分子量为42 313.15~70 689.98 D,等电点为5.30~9.15。利用Plant-m Ploc在线软件进行亚细胞定位预测,显示甜橙的MAPK都定位在细胞核(表2)。序列比对表明,甜橙中MAPK基因大多分布在不同的染色体上,其中Cs MPK4-1、Cs MPK6和Cs MPK8所位于的染色体未知(表2)。
图表编号 | XD00200503300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.25 |
作者 | 龙琴、谢宇、雷天刚、何永睿、许兰珍、邹修平、陈善春 |
绘制单位 | 西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心、西南大学、中国农业科学院柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心 |
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