《表1 甜橙中鉴定出的CsbHLH基因家族成员及其基本特性》

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《甜橙bHLH转录因子家族的鉴定及生物信息学分析》


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研究者利用是否含有保守结构域bHLH基序(PF00010),在拟南芥[14]中鉴定出bHLH TFs144条,鉴于此,利用该保守结构域鉴定柑橘中的bHLH基因,然后通过NCBI BlastP和Citrus Sinensis Annotation Project数据库(http://citrus.hzau.edu.cn/orange/index.php)在柑橘基因组中搜索验证,最终获得126个bHLH基因(表1)。其内含子数目介于0~12之间,其中CsbHLH002、CsbHL-H012、CsbHLH041、CsbHLH068、CsbHLH124、CsbHLH126不含有内含子,CsbHLH087最多含12个内含子。