《表1 玉米SAUR基因家族的鉴定及特性》
通过Pfam数据库查找并下载SAUR基因家族中的隐马氏模型文件号码(PF02519),搜索玉米基因组数据库,使用SMART和CDD网站进行蛋白序列结构域检测,除去冗余,最终得到91个玉米SAUR基因序列,命名为Zm SAUR1~Zm SAUR91(表1)。由表1可知,分析玉米91个SAUR蛋白序列发现不同蛋白差异很大:编码SAUR蛋白氨基酸长度范围从79 aa(Zm SAUR34)~918 aa(Zm SAUR88),开放阅读框是从240 bp(Zm SAUR34)~9300 bp(Zm SAUR15),分子量范围从8.82 kD(Zm SAUR77)~101.18 kD(Zm SAUR88),等电点范围从4.63(Zm SAUR81)~11.8(Zm SAUR87),蛋白含1~18个内含子。通过表1发现SAUR蛋白的特性变化与序列长度变化都很大。并且发现有20个蛋白等电点小于7,说明部分SAUR蛋白编码弱酸性蛋白,会在酸性亚细胞的环境中发挥作用。
图表编号 | XD0049132300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.16 |
作者 | 郭栋、杜媚、周宝元、刘颖慧、赵明 |
绘制单位 | 中国农业科学院作物科学研究所、河北北方学院、河北北方学院、中国农业科学院作物科学研究所、河北北方学院、中国农业科学院作物科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |