《表1 引物序列及用途:亚洲百合MYB转录因子家族的鉴定及调控花粉败育MYB基因的筛选》
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《亚洲百合MYB转录因子家族的鉴定及调控花粉败育MYB基因的筛选》
MYB:v-myb禽成髓细胞瘤病毒致癌基因同源物;下同
亚洲百合MYB表达量用FPKM(fragments per kb per million)的log2转化值表示,数据来自百合转录组数据库(GenBank No.PRJNA523474),共获得LK-1(小孢子发育正常的减数分裂时期)和LK-2(败育发生的单核花粉粒时期)2个时期的数据。采用Mev软件对百合MYB转录因子基因在2个发育期的表达数据分析并按照欧式距离(euclidean distance)进行分层聚类分析。参考王雪倩等(2019)方法,以反转录的百合cDNA为模板,选取6个基于转录组数据筛选的在花粉败育时期表达量变化明显且和花粉发育密切相关的MYB转录因子基因进行qRT-PCR验证分析。引物设计见表1,q RT-PCR按照SYBR Premix Ex-Taq试剂盒(TaKaRa,大连)操作说明进行。百合转录组中β-Actin(Unigene3024_All)作为内参基因,与6个LaMYB基因一起扩增,每个处理设置为3次生物学重复,并对所得数据进行显著性检验。
图表编号 | XD00109944400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.25 |
作者 | 王雪倩、袁国振、吴泽、李茜、滕年军 |
绘制单位 | 南京农业大学园艺学院、农业部景观设计重点实验室、八卦洲现代园艺产业科技创新中心、南京农业大学园艺学院、农业部景观设计重点实验室、八卦洲现代园艺产业科技创新中心、南京农业大学园艺学院、农业部景观设计重点实验室、八卦洲现代园艺产业科技创新中心、南京农业大学园艺学院、农业部景观设计重点实验室、八卦洲现代园艺产业科技创新中心、南京农业大学园艺学院、农业部景观设计重点实验室、八卦洲现代园艺产业科技创新中心 |
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