《表1 杨树FBL基因家族定量PCR引物序列》

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《杨树miR393对FBL基因家族成员调控作用的鉴定》


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使用Primer3(http://frodo.wi.mit.edu/primer3/input.htm)对ptc-miR393和FBL家族基因进行定量PCR的引物设计,引物设计原则为20~25 bp长度,退火温度58~60℃,PCR产物长度为150~250 bp,引物序列见表1,其中PP2A-2为内参基因。定量PCR反应体系为:10μL KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix(#K4601,KAPA)、2μL上述稀释20倍的cDNA、定量上下游引物(10μmol)各0.8μL和6.4μL去离子水,每个样本进行4个技术重复。在LightCycler 480定量PCR仪(Roche)上进行定量PCR的运行,PCR扩增程序为:95℃3 s;95℃10 s,60℃30 s,72℃3 s,重复45个循环;95℃3 s。融解曲线分析条件:95℃5 s(以每s增加0.11℃的速率使65℃增至95℃)。