《表2 无义突变的RNA编辑位点》

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《烟草叶绿体基因组RNA编辑位点的鉴定与分析》

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注:G:根；H:花；Y:叶

基因组和RNA-seq测序数据的质量符合要求（图1）。通过数据质控、比对到参考基因组以及RNA编辑位点鉴定等步骤，在K326中发现了1 002个C-U转换的RNA编辑位点（图2），有24个位点在以前的研究已有报道，其它的位点都是新发现的。叶中发现348个，每个位点的平均测序覆盖度为134；花中504个，每个位点的平均测序覆盖度为45；根中652个，每个位点的平均测序覆盖度为34。在1 002个编辑位点中，609个编辑位点位于63个蛋白编码基因（表1），占所有编辑位点的60.8%，其中无义突变的编辑位点46个（表2）；53个编辑位点位于13个RNA基因（t RNA和r RNA）（表1），占所有编辑位点的5.3%；340个编辑位点位于基因间区，占33.9%。在叶绿体的96个蛋白编码基因中，63个基因发现了RNA编辑位点，占65.6%；在叶绿体的45个RNA基因中，13个基因发现了RNA编辑位点，占28.9%。蛋白编码基因中，rpo C2、ycf1、ndh D有最多的RNA编辑位点，分别达到54个、33个、30个；RNA基因中trn G、trnf M、trn D发现的RNA编辑位点最多，分别有16个、7个、6个。