《表6 紫苏叶绿体基因组RNA编辑位点预测》

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《紫苏叶绿体全基因组特征分析》

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使用Prep-cp软件对紫苏叶绿体基因组的88个蛋白编码基因进行分析，共预测到37个RNA编辑位点，分布于16个基因上（表6），且均为特定的碱基C脱氨基变成U。密码子第1位碱基上的RNA编辑位点有8个，第2位碱基上有29个，而第3位碱基上没有发现RNA编辑位点。RNA编辑位点最多的是ndh B，有9个；rpo B次之，有6个。此外，这些编辑位点中共有10种氨基酸转变类型，其中，S→L(15个）、P→L(4个）、S→F(4个）、H→Y(3个）、R→W(2个）、U→L(1个）是亲水性氨基酸变成疏水性氨基酸，有29个，占比约78.38%；由疏水性变成亲水性的氨基酸是L→F(2个），占比约5.41%；其他氨基酸转变类型有A→V (3个）、U→M (2个）、R→C(1个）。所以，蛋白质一级结构大部分是由亲水性转变为疏水性，这将增加蛋白质的疏水性。