《表4 不同编辑条件下基因组位点编辑比例比较》

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《谷氨酸棒杆菌碱基编辑的条件优化》

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为了进一步验证上述最优碱基编辑条件适用于谷氨酸棒杆菌基因组其他位点，选取实验室前期已构建、含nCas9（D10A）-AID融合蛋白且gRNA靶标不同基因（Cgl0025、Cgl0369、Cgl1314）的3株菌，分别在初始编辑条件与最优编辑条件下对靶标位点进行编辑。编辑结束后，两种不同编辑条件下，每种菌株各挑取10个单克隆，对靶标位点进行测序。gRNA序列中任意一个靶标C位点被编辑即视为该单克隆得到编辑，以编辑的单克隆数所占比例来衡量编辑效率。如表4所示，通过比较，3株菌在最优碱基编辑条件下的编辑比例提高了1.7–2.5倍，证明了上述优化结果的有效性及通用性。