《表1 不同类型基因组编辑效率统计》

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《新型生长快速需钠弧菌基因组无痕编辑体系构建》

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为了测试需钠弧菌的自然转化效率，用两种筛选标记基因cat-sac B和KanR分别替换需钠弧菌基因组上的dns （BA890＿12415，编码Deoxyribonuclease I）[3]。在IPTG诱导条件下，含有p MB1-tfo X质粒的需钠弧菌对cat-sac B和KanR片段的转化效率分别达4×10–5和4×10–4，均明显高于IPTG未诱导和空载对照p MB1菌株（图4A和4B）。当同源重组片段的两条同源臂长度分别为600 bp时，由于cat-sac B重组片段的长度为4 144 bp，明显长于KanR片段的长度2 327 bp，因此转化同样质量的t DNA，cat-sac B片段的转化效率要低于KanR （图4A和4B）。通过统计分析，cat-sac B和KanR片段的同源重组正确率分别达到97.1%和100%（表1）。部分cat-sac B和KanR同源重组转化子的琼脂糖凝胶电泳检测结果如图4E所示，结果显示均正确。