《表1 基因组中不同类型微卫星统计》

《表1 基因组中不同类型微卫星统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)全基因组微卫星分布特征分析》


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黄颡鱼全基因组大小为713 810 725 bp,一共组装到663个Scaffolds上。其中包含SSR的Scaffolds共计654个,650个Scaffolds上包含一个以上SSR。共计筛选出418 550个完整型微卫星,相对丰度为586个/Mb,微卫星的长度共计为12 974 321 bp,占黄颡鱼全基因组序列总长度的1.8%,相对密度为18 176 bp/Mb。在1~6不同碱基重复类型微卫星中,各类型微卫星的重复数目分布差异较大。二碱基重复数目最多,共173 177个,占微卫星总数的41.38%。然后依次是单碱基(168 500个,40.26%)、四碱基(39 227个,9.37%)、三碱基(31 951个,7.63%)、五碱基(4 798个,1.15%)和六碱基(897个,0.21%)(表1)。