《表2 叶城沙蜥基因组中分布频率最高的微卫星重复类型》

《表2 叶城沙蜥基因组中分布频率最高的微卫星重复类型》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于Roche 454 GS FLX高通量测序的叶城沙蜥基因组微卫星特征分析》


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同一种类型的重复序列中,各重复拷贝类型所占的比例不相同(表2)。二碱基重复类型中,AC重复拷贝类型最多,占二碱基重复序列总数的54.94%,有4 697个,其次是AG(37.20%)和AT(6.84%),CG最少,只有87个,占1.02%。三碱基重复类型中,有9种重复拷贝类型,数量较多的是ATC和AAT,分别有588个和498个,占三碱基重复序列总数的18.78%和15.90%,其他类型详见表2。四碱基重复类型的重复拷贝类型有27种,最多的是AAAT,有1 288个,占四碱基重复序列总数的40.16%,其次是ATAG,占15.06%,其他类型相对较少,占比均不超过10%。五碱基重复类型中,AAAAT重复拷贝类型最多,有87个,占五碱基重复序列总数的31.75%;其次是AAAAC(16.42%)、AATAG(5.11%)、AAAAG(4.01%),其他类型均不超过10个。六碱基重复类型中,最多的是AATCCC,有20个,占六碱基重复序列总数的20.62%,其他类型均不超过20个。