《表1 藏鸡DNA序列中不同微卫星重复基元出现的频率》

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《藏鸡基因组微卫星特征分析》


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在111 233条藏鸡DNA序列中,共找到411 761个SSR,序列在其拼接总长度1 073 691.5 kb,有14 295条序列含不同重复基元SSRs,带有SSR同等序列的频率百分比12.85%,SSR的出现频率为0.38个SSR/1 kb。SSR序列组装的总长度大致为7 971.02 kb,约占整个DNA序列的1.0%。统计重复基元总数,在411 761个SSR中共有1 055种重复基元(Motif),占所有重复基元总数份额最高的是单核苷酸(47.49%),二(24.33%)、三(14.80%)、四(14.68%),五(4.29%)和六核苷酸重复基元(6.63%),藏鸡基因组中从微卫星的分布密度来看,SSR序列平均相隔2.61 kb显现一个(见表1),各种重复单元微卫星所呈现的数目差异与密度的范围呈正相关。