《表3 半枫荷转录组中各SSRs类型中不同重复次数出现频率》
半枫荷不同类型的EST-SSR位点基序之间的重复频率差异很大(表3)。单核苷酸基序中,重复次数变化范围为10~57次,其中,重复次数最多的是10,占总EST-SSR位点的11.33%,重复次数10~16的基序数量较多。一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸基序重复次数变化范围分别为10~57次、6~33次、5~18次、5~8次、5~9次和5~9次,它们重复次数较多的基序分别为10~16次、6~12次、5~6次、5~6次、5次和5~6次。可见,随着半枫荷EST-SSR中核苷酸基序类型复杂程度的增加,重复变化范围和重复出现的概率均呈逐渐变小的趋势。结合半枫荷EST-SSR位点基序的重复次数介于5~57之间(表3),其中6次和10次重复数量最多,分别有2 314个和2 210个位点,分别占总EST-SSR位点的15.38%、14.69%;其次为5次、11次、7次和12次重复,位点个数分别为1 511次、1 466次、1 383次和1 177次。半枫荷EST-SSR位点重复次数主要分布范围介于5~14次,共有12 916个,占总EST-SSR位点85.87%。
图表编号 | XD00152816600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.14 |
作者 | 叶兴状、杨先吉、王妙青、刘宝、范辉华、汤行昊、张国防、曾桂华、郑世群 |
绘制单位 | 福建农林大学林学院、福建农林大学林学院、福建农林大学林学院、福建农林大学林学院、福建省林业科学研究院林业生物技术研究开发中心、福建省林业科学研究院林业生物技术研究开发中心、福建农林大学林学院、福建农林大学林学院、福建农林大学林学院 |
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