《表1 基于重复单元的SSRs在意蜂幼虫肠道转录组中的出现频率》

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《利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记》


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本研究共预测出6 312个SSR位点,它们分布于2 149条转录本,出现频率为17.73%。此外,1 127条转录本含有的SSR位点数超过1个。这些SSR基元包含1~5 bp的串联重复序列。在意蜂幼虫肠道转录组数据中,SSR基元的重复类型总数最多的是二核苷酸,达SSR总数的54.42%,其次是三核苷酸,占SSR总数的32.49%,最少的是四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸,分别占SSR总数的9.17%、2.41%和1.51%(表1)。意蜂幼虫肠道转录组SSR重复单元的重复次数介于4~46次。二核苷酸重复次数介于6~46次,三核苷酸重复次数介于5~27次,四核苷酸重复次数介于4~16次,五核苷酸重复次数介于4~10次,六核苷酸重复次数介于4~11次。重复次数最多的为6次(25.10%)。