《表3 意大利蝗转录组中SSRs类型及数目》

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《基于转录组数据的意大利蝗微卫星位点分析与分子标记开发》


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意大利蝗SSR重复基序中,单核苷酸重复所占比例最高,为60.88%;其次为二核苷酸、三核苷酸和四核苷酸,分别占SSR总数的23.58%、12.99%和2.04%;五核苷酸和六核苷酸重复的含量较少,分别占SSR总数的0.45%和0.06%(表3)。在单核苷酸重复中,A/T基序为主要类型,所占比例为44.38%,其次为C/G基序(16.50%)。二核苷酸重复中AC/GT(12.99%)和AG/CT(8.05%)基序为主要类型。三核苷酸重复中超过1%的基序有AAT/ATT、AAG/CTT、AGC/CTG、AAC/GTT、CCG/CGG和ATC/ATG,其比例分别为2.84%、2.24%、1.63%、1.53%、1.30%和1.13%。四核苷酸中AAAT/ATTT基序最多,所占比例为0.72%(图1)。