《表2‘哈斯’与‘福尔特’油梨转录组中SSRs的分布》

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《两个油梨品种转录组SSR特征比较分析及其分子标记开发》


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对‘Hass’和‘Fuerte’油梨转录组中获得的SSR数据进行统计分析的结果显示(表2):SSR数目从大到小依次是二碱基重复>三碱基重复>四碱基重复>六碱基重复>五碱基重复,二碱基与三碱基微卫星重复是油梨转录组中的主要类型,总和分别占到各自品种总SSR数的86.68%和87.15%。在‘Hass’品种中,二至六碱基重复基元数目及比例分别为3 124(48.44%)、2 466 (38.24%)、445 (6.90%)、170 (2.64%)、244 (3.78%),其中三碱基重复5次的SSR个数最多,达1 360个。在所有基元重复次数中,重复5次也是最多的,达1 539次(23.86%),其次为重复6次,达1 400次(21.71%)。在‘Fuerte’品种中,二至六碱基重复基元数目及比例分别为3 050 (48.32%)、2 451(38.83%)、420 (6.65%)、155 (2.46%)、236 (3.74%),三碱基重复5次的SSR个数最多,为1 350个,所有基元重复次数中5次重复最多,为1 543次(24.45%),其次是6次重复为1 371次(21.72%)。在两个油梨转录组中,不同碱基重复类型的丰度差异较小,其中二碱基和三碱基重复类型的丰度远高于其他重复类型(图1)。