《表1 泥东风螺转录组中EST-SSRs重复次数分布》

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《泥东风螺EST-SSR开发及其群体遗传多样性分析》

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利用MISA软件对Unigenes的cDNA序列数据中筛选1 kb以上的Unigenes进行SSR分析，共筛选到16324个SSR符合设置条件（表1），泥东风螺转录组中SSR种类丰富，共有181种重复类型；各种类型的出现频率差异较大，主要集中在单核苷酸重复、二核苷酸重复和三核苷酸重复，分别占SSR总数量的40.17%、29.75%和15.27%，四核苷酸重复和五核苷酸重复数量少，分别占0.76%和0.04%，未发现多于5个核苷酸重复。SSR在整个泥东风螺转录组中的出现频率和发生频率分别为13.62%和6.86%，平均每350.78 kb出现1个SSR。各种重复基元出现频率差异大（表2），如：AC/GT重复基元占二核苷酸重复的70.58%，AGG/CCT和ACC/GGT重复基元分别占三核苷酸重复的22.60%和20.50%。从整体分布分析中发现多核苷酸重复序列以重复6次出现频率占优势。长度为12～20 bp的SSR占63.95%，长度为21～25 bp的SSR占9.14%，总体的平均长度为18.4 bp。