《表2 不同柑橘木虱转录组中lncRNA分布总数》

《表2 不同柑橘木虱转录组中lncRNA分布总数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证》


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利用所构建的lncRNA预测流程,从13组柑橘木虱转录组中共预测获得10 192个lncRNA基因,对应15 747条lncRNA转录本(图1)。根据lncRNA在基因组的位置信息,将lncRNA分为7类:基因间区lncRNA、内含子区lncRNA、与参考基因内含子反义链有重叠的lncRNA、与参考基因外显子正义链有重叠的lncRNA、与参考基因外显子反义链有重叠的lncRNA、与参考基因剪切位点重叠的lncRNA及未知类的lncRNA。其中,基因间区lncRNA数量最多,共3 416条,占总数的33.52%;与内含子反义链重叠的lncRNA数量最少,仅占0.25%(表2)。为研究黄龙病病原菌对柑橘木虱lncRNA的影响,重点分析了带菌和无菌样本中发现的lncRNA。在无菌成虫和无菌若虫中,分别发现了7 511个和7 057个lncRNA基因;带菌成虫和带菌若虫中发现的lncRNA数量更少,分别为7 263个和5 737个lncRNA基因(表2)。