《表2 不同柑橘木虱转录组中lncRNA分布总数》
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《LncRNA在柑橘木虱与黄龙病病原菌互作中的差异表达分析及验证》
利用所构建的lncRNA预测流程,从13组柑橘木虱转录组中共预测获得10 192个lncRNA基因,对应15 747条lncRNA转录本(图1)。根据lncRNA在基因组的位置信息,将lncRNA分为7类:基因间区lncRNA、内含子区lncRNA、与参考基因内含子反义链有重叠的lncRNA、与参考基因外显子正义链有重叠的lncRNA、与参考基因外显子反义链有重叠的lncRNA、与参考基因剪切位点重叠的lncRNA及未知类的lncRNA。其中,基因间区lncRNA数量最多,共3 416条,占总数的33.52%;与内含子反义链重叠的lncRNA数量最少,仅占0.25%(表2)。为研究黄龙病病原菌对柑橘木虱lncRNA的影响,重点分析了带菌和无菌样本中发现的lncRNA。在无菌成虫和无菌若虫中,分别发现了7 511个和7 057个lncRNA基因;带菌成虫和带菌若虫中发现的lncRNA数量更少,分别为7 263个和5 737个lncRNA基因(表2)。
图表编号 | XD00128910300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.01 |
作者 | 陈梦瑶、曹征鸿、贺康、梅洋、魏圣飞、肖花美 |
绘制单位 | 宜春学院生命科学与资源环境学院江西省作物生长发育调控重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室、宜春学院生命科学与资源环境学院江西省作物生长发育调控重点实验室、浙江大学昆虫科学研究所农业农村部作物病虫分子生物学重点实验室 |
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