《表1 不同重复单元类型在密斑刺鲀转录组中出现的频率》

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《基于RNA-seq数据的密斑刺鲀SSR分子标记开发及鉴定》

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搜索到的全部SSR位点共有403种类型的碱基组合，其中四碱基重复单元的种类最多（161种），其次为五碱基重复单元（109种），再次为三碱基和六碱基重复单元（分别为60和57种）。6种重复单元类型的SSR位点数量存在明显的差异，单碱基重复单元的SSR位点数量最多（54 792个），占所有SSR位点数量的51.58%，分布在39 584条Unigene上，发生频率为48.99%，而六碱基重复单元的SSR位点数最少（仅99个），占比为0.09%，分布在97条Unigene上，发生频率为0.12%。不同类型重复单元的平均距离存在差异，其中单碱基和三碱基重复单元的平均距离差异最大（分别为2 297和3 029 bp，表1）。