《表2 密斑刺鲀30个简单重复序列位点的引物信息》

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《基于RNA-seq数据的密斑刺鲀SSR分子标记开发及鉴定》

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当SSR长度在20 bp及以上时，该位点在不同品种间表现出较高的多态性[17]。选取SSR长度大于等于20 bp的位点，利用Primer 3软件获得17 563个SSR位点的引物，随机挑选了160个位点的引物进行PCR验证，筛选到95对有效扩增引物（占比59.38%），利用30条密斑刺鲀对这95对引物进行多态性验证，筛选到30个SSR位点的引物表现出稳定、可重复的多态性（图4），占有效扩增引物的32.63%。具有多态性的30个SSR位点的重复单元长度介于20～50 bp，平均长度为30.63 bp，其中有21个SSR位点是二碱基重复单元（占比70%），基本都是（AC/GT）n（表2）。