《表2 大花君子兰cp DNA简单序列重复(SSR)信息》

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《大花君子兰叶绿体基因组及其特征》


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从大花君子兰cp DNA中共检测出61个SSR位点,出现次数最多的为单核苷酸,全部由A/T组成,共38个,大约占全部SSR的62.3%;其次是二核苷酸,序列为AT/TA、TA/AT、GA/CT、TC/AG,共9个,约占全部SSR的14.75%;三核苷酸序列GAG/CTC、和ATT/TAA各1个;四核苷酸序列AATA/TTAT、ATAA/TATT、AAAT/TAAA、TTTA/AAAT、AATG/TTAC、TTGA/AACT、CATA/GTAT和TAAA/AAAT共8种各1个;五核苷酸序列为TTTAT/AAATA、CGAAA/GCTTT和TTTCG/AAAGC各1个;六核苷酸序列仅ATCTTA/TAGAAT 1个,约占总SSR的1.64%(表2)。以上SSR位点部分存在于基因内部,其他存在基因间隔区,在基因间隔区的分布(37个)多于基因内部(24个)。