《表2 SSR引物信息:基于SSR标记的68份红毛丹种质资源DNA指纹图谱构建》
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《基于SSR标记的68份红毛丹种质资源DNA指纹图谱构建》
SSR引物均由深圳华大基因科技有限公司合成。从前期开发的红毛丹SSR标记中随机挑选出50对引物,以果皮颜色、果实大小和口感差异大的6份红毛丹种质DNA(分别为BR2、BR5、R2、R10、R20、R60)为模板进行PCR扩增,最后筛选出10对扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物(表2),SSR-PCR体系为20μL,包括:30 ng DNA模板、0.2 mmol/L dNTPs、1.2μmol/L引物,2.0 mmol/L MgCl2和2.0U Taq DNA聚合酶。10×buffer、MgCl2、Taq DNA聚合酶均购自Thermo Fisher Scientific公司。SSR-PCR反应程序为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,60℃退火30 s,每个循环降1℃,72℃延伸1 min,共进行6个循环;94℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,共进行25个循环;72℃延伸5 min,10℃保存。PCR产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,恒功率60 W电泳1 h,银染显带。
图表编号 | XD0039525700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.25 |
作者 | 林兴娥、牛俊海、陈莹、明建鸿、高宏茂、葛宇、周兆禧 |
绘制单位 | 中国热带农业科学院海口实验站、中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所、海南大学热带农林学院、中国热带农业科学院海口实验站、中国热带农业科学院海口实验站、中国热带农业科学院海口实验站、中国热带农业科学院海口实验站 |
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