《表4 苹果、梨、桃RKD基因中的简单重复序列》

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《蔷薇科苹果、梨和桃RKD转录因子家族比较分析》


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表中基序一列括号后数字表示基序单元重复次数。

植物基因组中的简单重复序列因其多态性与可靠性,广泛地用于分子标记辅助选择育种(molecular marker-assisted selection,MAS)。本文扫描了22个RKD基因序列,发现共有20个SSRs (表4)。对于5种SSRs检测类型,五核苷酸重复(pentanucleotide SSRs)没有检测到。其中,二核苷酸重复(dinucleotideSSRs)、三核苷酸重复(trinucleotide SSRs)、四核苷酸重复(tetranucleotide SSRs)、六核苷酸重复(hexanucleotide SSRs)分别有8、6、1、5个。Mp RKD5基因上存在的SSRs最多,有3个,分别是AT重复9次的二核苷酸重复、CAA重复4次的三核苷酸重复以及ATACAT重复3次的六核苷酸重复。