《表1苹果、梨、桃RKD转录因子信息》

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《蔷薇科苹果、梨和桃RKD转录因子家族比较分析》


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为了比较苹果、西洋梨、桃中RKD蛋白的亲缘关系与系统分类,我们对上文鉴定的RKD转录因子进行进化发育与层次聚类分析,最终得到RKD蛋白系谱树(包括5个拟南芥RKD序列和4个蒺藜苜蓿RKD序列),结果如图1所示。在进化树中,RKD蛋白主要存在两类分支,由此可分为I类蛋白与II类蛋白。其中,I类RKD蛋白数目较多(包括17个上述鉴定成员),拟南芥5个RKD蛋白均位于此分支。II类RKD蛋白包括苹果Mp RKD7和Mp RKD9、西洋梨Pc RKD1和Pc RKD2、桃Pp RKD1,共5个鉴定成员;另外,蒺藜苜蓿Mt RKD4也位于这一分支。I类蛋白根据进化树拓扑结构又可进一步分为I-1~I-3三个分群,拟南芥At RKD1~At RKD3分布于I-1亚组,At RKD4和At RKD5分别定位于I-2、I-3两个亚组。