《表2 苹果、桃和草莓转录因子的数目Table 2 Number of transcription factors in apple, peach and strawberry》

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《苹果基因组中转录因子的鉴定与分析》

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目前，蔷薇科植物苹果、桃和草莓的测序工作已全部完成，其基因组数据是公开免费的。为了筛选3个物种全基因组序列中编码的转录因子，该研究利用DNA结合结构域和基序对所有蛋白质序列进行了系统鉴定。最终，通过生物信息学手段在苹果基因组中鉴定出3 039个转录因子家族基因，约占苹果总编码基因总数的4.87%（E值<0.01），在桃和草莓全基因组中分别鉴定到1 527个（约占5.31%）和1 506个（约占4.31%）转录因子家族基因。根据DNA结合域的同源性可以将所有的转录因子分为58个家族，如表2所示。其中，MYB转录因子家族（包括MYB和MYB相关家族）成员最多，苹果、桃和草莓中各包含375个（12.33%）、170个（11.13%）和157个（10.43%）基因成员；其次是AP2-EREBP、NAC、b HLH、MADS和WRKY转录因子家族；另外，在苹果基因组中未发现NOZZLE转录因子家族成员（表2）。