《表2 新疆野苹果NAC转录因子的统计信息》

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《新疆野苹果NAC基因分析及抗腐烂病基因筛选》

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利用构建的NAC转录因子的隐马可夫模型，从新疆野苹果转录组数据库中初步检索出170条候选蛋白序列，随后利用SMART数据库逐一鉴定NAC结构域并剔除冗余，最终得到165个MsNACs，依次命名为MsNAC001～165。利用Protparam对新疆野苹果NAC蛋白的理化性质进行预测，发现165个新疆野苹果NAC转录因子在分子质量、理论等电点及亲水性等方面均有不同程度的差异（表2）。其中MsNAC003氨基酸数目最多有859个，其分子质量为95.86 ku；而MsNAC150的氨基酸数目最少，仅有58个，其分子质量为6.77 ku。就理论等电点而言，所有MsNAC蛋白的理论等电点介于4.59～10.05，其中有104个NAC蛋白的理论等电点处于酸性范围，表明其所含酸性氨基酸较多。就疏水性而言，MsNACs的疏水性介于-0.054～-1.029，其中亲水性蛋白有150个，两性蛋白仅15个。此外根据预测结果，有127个NAC蛋白的不稳定系数高于40，表明大部分的NAC蛋白为不稳定蛋白。