《表4 8个简单重复序列位点在雌雄群体中的哈迪-温伯格平衡卡方检验概率及Uniprot数据库注释结果》
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《基于RNA-seq数据的密斑刺鲀SSR分子标记开发及鉴定》
注:NA.无注释结果
哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)检验可以反映出群体在随机交配过程中亲本和子代基因频率及基因型频率是否保持平衡[31]。群体容量不够、杂合子过剩或缺失、基因突变或选择、外源基因导入等均有可能引起这种偏离现象,而来自同一个随机交配群体的样本只能以很小的概率偏离HWE[32]。30个多态性SSR位点中有8个位点(104、206、522、528、646、703、717和S42)是显著偏离哈迪-温伯格平衡的(P<0.05),其中有3个位点(104、206和S42)属于高多态性位点(PIC>0.5)。由于所开发的SSR位点来自于雌雄转录组数据,因此,将30条密斑刺鲀按照雌雄分为两组,雄性组和雌性组的个体分别为13和17个,通过重新进行卡方检验哈迪-温伯格平衡,发现除了646号位点外,104和S42号位点在雄性群体中很好的服从了哈迪-温伯格平衡(P>0.05),而206、522、528、703和717号在雌性群体中服从哈迪-温伯格平衡(P>0.05),该结果暗示8个偏离哈迪-温伯格平衡的SSR位点可能与性别相关(表4)。需要说明的是,实验中所选择的雌雄群体的样本容量相对较小,导致实验结果可能存在一定的偏差,为了检验该结果,需要在今后的实验中扩大样本容量。
图表编号 | XD00121291300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.05 |
作者 | 马军、刘嘉鑫、江智景、周永森、于振豪、王海山、陈燕、陈攀、黄海 |
绘制单位 | 海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学 |
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