《表3 30对简单重复序列引物在密斑刺鲀群体中的遗传多样性参数》
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《基于RNA-seq数据的密斑刺鲀SSR分子标记开发及鉴定》
注:**.哈迪-温伯格平衡卡方检验P<0.01;*.哈迪-温伯格平衡卡方检验P<0.05;下表同此
在鱼类SSR的二碱基重复单元中,(AC/GT)n型重复单元往往占多数,而(CG/CG)n型重复单元的位点却很少[21,24-25]。研究中共筛选到19 906个SSR序列长度大于等于20 bp的Ⅰ型SSR位点(不包含复合型SSR),占全部SSR位点的18.74%,其中二碱基重复单元型SSR位点为10 545个(52.97%),单和三碱基重复单元型SSR位点分别为3 424(17.20%)和3 207个(16.11%)。在二碱基重复单元中,(AC/GT)n所占比例最高,为筛选到的Ⅰ型SSR位点的43.2%,而(GC/CG)n型重复单元几乎为零,这与东方红鳍鲀[24]、双须骨舌鱼[21]、翘嘴鳜[12]、牙鲆[13]、草鱼[26-27]等发现的结果较为一致。值得注意的是,本研究验证实验中筛选到的30个具有多态性的SSR位点中,有16个是(AC/GT)n型重复单元(表3),这提示从(AC/GT)n型重复单元中筛选具有多态性SSR位点的概率更高。
图表编号 | XD00121291100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.05 |
作者 | 马军、刘嘉鑫、江智景、周永森、于振豪、王海山、陈燕、陈攀、黄海 |
绘制单位 | 海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学院、海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室、海南热带海洋学 |
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