《表4 部分SSR重复类型及引物序列》

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《基于转录组的黑果枸杞SSR分布特征分析及引物设计》

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黑果枸杞转录组SSR序列长度变化显著，在单碱基至六碱基重复类型中，总体长度的变化在10～39 bp之间，平均长度为12.87 bp（图2）。单碱基重复、二碱基重复、三碱基重复、四碱基重复、五碱基重复和六碱基重复的平均序列长度分别为11.95 bp、14.55 bp、16.46 bp、20.58 bp、26.67 bp和32.18 bp（表4），其中三碱基重复长度变异幅度最大，最小为12 bp，最长达39 bp，其次是单碱基（10～32 bp）、五碱基（15～35 bp）、四碱基（15～32 bp）和二碱基（12～24 bp），而六碱基重复长度变异幅度最小（30～36 bp）。随着各重复碱基序列长度的增加，相对应SSR的数量依次减少，即呈相反的变化趋势；从重复单元类型来看，AGC/CTG（15～39 bp）类型长度变化范围最广；从长度分布中可以看出，黑果枸杞全部SSR位点中长度为10 bp的所占比例最高（26.42%），其次是11 bp（12.73%）、12 bp（12.23%）、15 bp（10.09%）以及14 bp（7.14%），其中>20 bp的黑果枸杞SSR位点共有376个（1.86%），且随着片段长度的增加其对应SSR数量所占比例呈逐渐降低的趋势（图2）。