《表3 分布频率最高的重复类型微卫星的拷贝数分布》

《表3 分布频率最高的重复类型微卫星的拷贝数分布》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于Roche 454 GS FLX高通量测序的叶城沙蜥基因组微卫星特征分析》


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二代测序出现前,对于非模式生物,微卫星重复类型的获得均是一个瓶颈(Guichoux et al.,2011)。随着高通量测序技术的发展,测序成本逐渐降低,可获得的数据越来越多,这为进一步增进对非模式物种的深度了解提供了契机。Nie等(2015)运用高通量测序技术对青海沙蜥进行转录组测序,鉴定、筛选出25个微卫星位点,其中17个可在叶城沙蜥中扩增;而经Bonferroni校正后,其中有9个显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.01),且这些位点的扩增适用性及多态性尚未在叶城沙蜥的不同种群中验证。本研究使用高通量测序技术对叶城沙蜥进行基因组SSR分子标记开发及分析,并基于Krait(Du et al.,2018)对基因组中完美型微卫星进行统计,深化了对叶城沙蜥基因组的认识和了解,并为下一步开发和筛选大量高质量微卫星标记提供数据支持,还为利用微卫星标记研究叶城沙蜥种群遗传结构和谱系地理模式奠定了基础。